《生物信息学技术在水稻功能基因研究中的应用》概述了水稻种子中蛋白质的种类和特性,重点介绍了谷蛋白结构、组成及其基因特点。阐述了利用生物信息学技术克隆分析水稻功能基因,具有投入少、速度快、技术要求低和针对性强等优点。设计了两个运用生物信息学技术克隆水稻谷蛋白基因的实验,并最终成功获得了3个较有价值的谷蛋白新基因。《生物信息学技术在水稻功能基因研究中的应用》可供从事分子生物学研究的本科生、研究生和科研工作者参考使用。
第1章 水稻谷蛋白研究进展
1.1 水稻贮藏蛋白
1.2 水稻谷蛋白的生物合成
1.3 水稻谷蛋白基因的克隆及其结构与表达分析
1.4 谷蛋白与水稻育种
1.4.1 水稻谷蛋白突变体的形成途径
1.4.2 水稻低谷蛋白突变体LGC-1
第2章 水稻功能基因的电子克隆
2.1 水稻功能基因电子克隆的方法
2.1.1 利用EST数据库信息
2.1.2 利用基因组信息
2.2 与水稻功能基因电子克隆相关的生物信息资源
2.3 电子克隆中的一些常见问题和对策
2.4 水稻电子克隆技术的展望
第3章 水稻谷蛋白基因GluB-4的克隆与表达分析
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 全长GluB-4的克隆与序列分析
3.2.2 GluB-4 mRNA的组织特异性表达
3.2.3 GluB-4 mRNA的时间特异性表达
3.2.4 Southern杂交分析
3.3 讨论
第4章 LGC-1氐谷蛋白突变相关基因的GluB-5克隆与序列分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 试验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 已知谷蛋白基因在LGC-1和NM中表达无差异
4.2.2 利用生物信息学技术克隆到1个新谷蛋白基因GluB-5
4.2.3 新谷蛋白基因GluB-5在LGC-1中表达被抑制
4.2.4 新谷蛋白基因GluB-5RNA在LGC-1中发生了编辑
4.2.5 GluB-5在水稻基因组中数多拷贝基因
4.3 讨论
参考文献
缩略语